En la ejecución del Programa participan, entre otras, las siguientes instituciones:
Organismo Internacional
Organismos Públicos de Nivel Nacional
Gobiernos Regionales
Municipios provinciales y distritales del Ámbito del Programa, Universidades Locales (Públicas y Privadas), Comunidades campesinas y nativas, Organizaciones sociales y gremiales, Productores organizados.